Small RNA是生命活動重要的調控因子，短小的序列長度（如microRNA一般在18-30nt之間）;種類繁多，?siRNA（小干擾RNA?），?microRNA（微小RNA），還有其他一些種類的小RNA，如piRNA（蛋白互作小RNA），snRNA（小核RNA），snoRNA（核仁小RNA）等種類；幾乎存在于所有的生物體中；在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等過程中發揮著重要作用。Illumina能夠對細胞或者組織中的全部Small RNA進行深度測序及定量分析等研究。實驗時首先將18-30 nt范圍的Small RNA從總RNA中分離出來，兩端分別加上特定接頭后體外反轉錄做成cDNA再做進一步處理后，利用測序儀對DNA片段進行單向末端直接測序。通過Illumina對Small RNA大規模測序分析，可以從中獲得物種全基因組水平的miRNA圖譜，實現包括新miRNA分子的挖掘，其作用靶基因的預測和鑒定、樣品間差異表達分析、miRNAs聚類和表達譜分析等科學應用。

樣品要求：總RNA≥1.5ug；RNA樣品濃度≥250 ng/ul；

測序平臺及策略：Illumina HiSeq 2500 ，SE50，Q30 ≥ 85% 。

推薦單個樣本的測序數據不低于?8M clean reads。

項目周期：2個月

技術流程：

分析內容：

參考序列比對：分析測序reads比對率和覆蓋度

small RNA分類注釋：篩選并鑒定鑒定已知的和新的sRNA

堿基編輯分析：miRNA種子序列分析

差異表達分析：樣本間差異表達的sRNA

靶基因預測：sRNA作用的靶基因信息

差異sRNA ：靶基因

GO、KEGG富集：深入挖掘sRNA功能